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Per quanto riguarda la salute, la razza cane lupo cecoslovacco si dimostra piuttosto sana, senza particolari patologie che affliggono altre razze; di norma utilizziamo in riproduzione solo cani che al controllo radiografico per la displasia siano risultati esenti (HD A) o al massimo HD B.
Come già avviene nel Paese di origine della razza, talvolta viene utilizzato in allevamento il grado C (che è lieve displasia, generalmente non invalidante) purchè accoppiato con un grado A.
E' una scelta che talvolta si può fare per caratteristiche particolari dei soggetti utlizzati, purchè non sia la norma in un piano di allevamento.
Va ricordato che la displasia, patologia poligenica ovvero dovuta a più geni, una volta accertata dal Veterinario tramite opportune lastre e confermata dalle Centrali di lettura riconosciute, si sviluppa anche e soprattutto in base all'ambiente (infatti è definita multifattoriale), pertanto raccomandiamo sempre attenzione col cucciolo e col giovane cane per evitare sovralimentazione ed eccessivo esercizio fisico fino all'anno di età circa.
Nel piano di selezione, oltre alla condizione degli ascendenti diretti, deve essere valutata anche la condizione dei collaterali. Per esemplificare al massimo, un grado C i cui genitori e fratelli sono di grado A, è meno preoccupante di un grado A i cui genitori o fratelli sono C, D, E. In questo caso se ne sconsiglia l'utilizzo in allevamento.
Di recente scoperta è il gene che risulta essere la causa base della Mielopatia Degenerativa, grave patologia incurabile che, seppur non frequentemente, può colpire anche il Cane Lupo Cecoslovacco.
Il cosiddetto soggetto dm/dm che presenta cioè il gene recessivo in omozigosi, potrebbe ammalarsi in età adulta/avanzata a fronte di elementi scatenanti.
Tale soggetto, nel momento in cui lo si riconosce portatore di pregi utili nel piano di allevamento, non è da escludere dalla riproduzione bensì deve essere accoppiato esclusivamente con soggetti N/N e cioè sani.
Sulla base di tali conoscenze, evitiamo accoppiamenti che possano produrre cuccioli che in età adulta ovvero avanzata corrano il rischio di ammalarsi puntando progressivamente a produrre solo soggetti N/N.